Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PANK1Q8TE04 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PANK1Q8TE04 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PANK1Q8TE04 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms