Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PATJQ8NI35 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATJQ8NI35 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATJQ8NI35 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATJQ8NI35 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATJQ8NI35 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PATJQ8NI35 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PATJQ8NI35 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms