Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET4

RTL9, Retrotransposon Gag-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL9Q8NET4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL9Q8NET4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL9Q8NET4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RTL9Q8NET4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL9Q8NET4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL9Q8NET4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL9Q8NET4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL9Q8NET4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL9Q8NET4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL9Q8NET4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL9Q8NET4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL9Q8NET4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms