Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BBOF1Q8ND07 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BBOF1Q8ND07 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BBOF1Q8ND07 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms