Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDPRQ8NCN5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms