Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP38Q8NB14 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP38Q8NB14 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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