Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38AQ8NAV1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38AQ8NAV1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38AQ8NAV1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38AQ8NAV1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38AQ8NAV1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF38AQ8NAV1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF38AQ8NAV1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF38AQ8NAV1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF38AQ8NAV1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms