Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G2

VGLL2, Transcription cofactor vestigial-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL2Q8N8G2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VGLL2Q8N8G2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VGLL2Q8N8G2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.56■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VGLL2Q8N8G2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms