Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7H5

PAF1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAF1Q8N7H5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAF1Q8N7H5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAF1Q8N7H5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAF1Q8N7H5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms