Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC33Q8N5R6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms