Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCL2Q8N4E4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCL2Q8N4E4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCL2Q8N4E4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms