Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXO39Q8N4B4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO39Q8N4B4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO39Q8N4B4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms