Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDR16C5Q8N3Y7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SDR16C5Q8N3Y7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 775.2 ms