Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PPM1KQ8N3J5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms