Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ8

MYOCD, Myocardin, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOCDQ8IZQ8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOCDQ8IZQ8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MYOCDQ8IZQ8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYOCDQ8IZQ8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms