Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHACTR4Q8IZ21 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHACTR4Q8IZ21 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms