Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKL3Q8IVW4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKL3Q8IVW4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms