Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FMNL3Q8IVF7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FMNL3Q8IVF7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FMNL3Q8IVF7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms