Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC49Q8IUZ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRC49Q8IUZ0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRC49Q8IUZ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms