Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRLF3Q8IUI8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRLF3Q8IUI8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms