Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CACUL1Q86Y37 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACUL1Q86Y37 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACUL1Q86Y37 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms