Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM228AQ86W67 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM228AQ86W67 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM228AQ86W67 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms