Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DSG4Q86SJ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms