Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CLASP1Q7Z460 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CLASP1Q7Z460 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CLASP1Q7Z460 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms