Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHST3Q7LGC8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHST3Q7LGC8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms