Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KNDC1Q76NI1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
KNDC1Q76NI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KNDC1Q76NI1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms