Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2R2Q712K3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2R2Q712K3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms