Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDHR3Q6ZTQ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms