Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RUFY4Q6ZNE9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RUFY4Q6ZNE9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms