Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXD4L3Q6VB84 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FOXD4L3Q6VB84 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms