Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABRAXAS1Q6UWZ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABRAXAS1Q6UWZ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms