Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TXNDC11Q6PKC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNDC11Q6PKC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms