Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM88Q6PEY1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM88Q6PEY1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms