Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZCCHC12Q6PEW1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZCCHC12Q6PEW1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms