Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CTR9Q6PD62 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTR9Q6PD62 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTR9Q6PD62 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms