Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLC3Q6P597 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms