Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CGB2Q6NT52 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB2Q6NT52 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms