Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC70Q6NSX1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC70Q6NSX1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms