Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC102BQ68D86 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC102BQ68D86 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms