Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E4F1Q66K89 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E4F1Q66K89 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms