Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PCNX4Q63HM2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX4Q63HM2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
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