Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PAPD7Q5XG87 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PAPD7Q5XG87 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms