Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SUSD4Q5VX71 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SUSD4Q5VX71 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SUSD4Q5VX71 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.2 ms