Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HIVEP3Q5T1R4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIVEP3Q5T1R4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms