Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAX1Q5SQQ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAX1Q5SQQ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms