Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CAVIN4Q5BKX8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAVIN4Q5BKX8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAVIN4Q5BKX8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms