Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTLL9Q3SXZ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTLL9Q3SXZ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms