Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRFIP1Q32MZ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRFIP1Q32MZ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRFIP1Q32MZ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms