Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C17orf58Q2M2W7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C17orf58Q2M2W7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms