Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Q1T7F1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q1T7F1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q1T7F1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q1T7F1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q1T7F1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q1T7F1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q1T7F1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q1T7F1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q1T7F1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q1T7F1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q1T7F1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q1T7F1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q1T7F1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q1T7F1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q1T7F1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q1T7F1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q1T7F1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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